شهیر شهیدثالث، تحلیلگر مستقل روابط بین‌الملل دانشگاه لندن، ژئوپلیتیک دانشگاه ساسکس در یادداشتی که در شبکه ایکس منتشر کرده درباره ضرب‌الاجل ۳۰ روزه پس از فعال شدن مکانیسم ماشه توسط طرف‌های اروپایی برجام نوشت:
علی خامنه ای
نیویورک تایمز جزئیات جدیدی از حمله اسرائیل به جلسه شورای عالی امنیت ملی و ترور دانشمندان هسته‌ای در جریان جنگ ۱۲ روزه منتشر کرد؛ اسرائیل با هک تلفن محافظان و رانندگان، فرماندهان نظامی ایران را هدف قرار گرفت و به محل جلسه شورای عالی امنیت ملی رسید.
یافته‌های نظرسنجی موسسه گمان در خرداد ۱۴۰۳ که تازه منتشر شده، نشان می‌دهد اکثریت قاطع ایرانیان با ادامه جمهوری اسلامی مخالف‌اند و خواهان تغییرات اساسی در ساختار سیاسی کشور هستند.
حسین باستانی، روزنامه‌نگار در یادداشتی در کانال تلگرامی خود درباره عدم حضور آیت‌الله علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی در مراسم اربعین بیت رهبری نوشت:
ابوالفضل قدیانی و مهدی محمودیان دو زندانی سیاسی در زندان تهران بزرگ در اعتراض به صدور حکم اعدام برای بابک شهبازی، زندانی سیاسی نوشتند: «وقتی طناب دار در کشور آویزان است، ما با چشمان باز، به تدریج می‌میریم.»
پس از چند روز گمانه‌زنی، علی لاریجانی، مشاور ارشد علی خامنهای، با حکم مسعود پزشکیان، به‌عنوان دبیر شورای عالی امنیت ملی جمهوری اسلامی منصوب شده است. لاریجانی پیش‌تر نیز بین سال‌های ۱۳۸۴ تا ۱۳۸۶ و در دوران ریاست جمهوری محمود احمدی‌نژاد۷ همین سمت را بر عهده داشت.
ایرنا خبر داده که علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی با استعفای کاظم صدیقی از امامت جمعه تهران، موافقت کرده است: «حجت الاسلام والمسلمین صدیقی در نامه خود به رهبر انقلاب ضمن تشکر به دلیل انتصاب خود به عنوان امام جمعه موقت تهران و اقامه نماز جمعه در هفده سال گذشته، خواستار معاف شدن از اقامه نماز جمعه به سبب تمایل برای تمرکز بر کارهای علمی و تدریسی و تبلیغی شده است.»
سقوط استراتژی رژیم؛ از جاه‌طلبی‌های منطقه‌ای به تقلا برای بقا
«امام غایب»؛ علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی پس از جنگ ۱۲ روزه در حال محو شدن زیر سایه‌هاست
اکونومیست در یادداشتی درباره وضعیت علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی نوشت: «پس از جنگ ۱۲روزه ایران با اسرائیل، آیت‌الله علی خامنهای به‌ندرت در انظار عمومی ظاهر می‌شود و قدرت او در حال کاهش است. خطبه‌هایش کوتاه شده و اختیارات به‌طور فزاینده‌ای به سپاه پاسداران و دیگر نهادها واگذار شده است. در غیاب نقش پررنگ رهبر، مباحث جانشینی شدت گرفته و فضای سیاسی کشور با تردید و رقابت پر شده است.»
علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی در مراسمی به مناسبت چهلمین روز کشته‌شده‌های جنگ ۱۲ روزه گفت: «ما در راه تقویت دین و گسترش و تعمیق دانش‌های گوناگون خود قدم‌های بلندی برخواهیم داشت و به کوری دشمن خواهیم توانست ایران را به اوج ترقی و افتخار برسانیم.»
نیویورک پست در گزارشی درباره علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی نوشت: «پس از پایان جنگ ۱۲ روزه، یک حساب کاربری مرموز در شبکه اجتماعی X (توییتر سابق) که ادعا می‌کند به سازمان اطلاعات اسرائیل (موساد) وابسته است، مدعی شد که آیت‌الله علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی ایران، بیشتر روزهای خود را در خواب یا در حالت «نشئگی» می‌گذراند.»
مصطفی تاجزاده، فعال سیاسی محبوس در زندان تهران بزرگ، در بیانیه‌ای علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی را مسئول وضعیت بحرانی ایران دانسته و تاکید کرده است که او یا باید به خواست ملت تن دهد و زمینه تغییرات بنیادین را فراهم کند یا از قدرت کناره‌گیری کند.
راجر کوهن، خبرنگار باسابقه نیویورک‌تایمز در مقاله‌ای که روز ۲۹ ژوئن ۲۰۲۵ منتشر شده، ایران پس از جنگ ۱۲روزه با اسرائیل و آمریکا را کشوری «بر لبه تیغ» توصیف می‌کند.
عبدالله گنجی، سردبیر پیشین روزنامه جوان وابسته به سپاه پاسداران انقلاب اسلامی، در حساب کاربری خود در ایکس که ۱۵۰ هزار دنبال‌کننده دارد، نوشت که در طول جنگ ۱۲ روزه «پدیده‌ای عجیب» رخ داده است: «اسرائیل در جریان جنگ اخیر خود با ایران از «علوم غریبه و ارواح ماورایی» بهره برده است.»
کاترین شکدم چند سال پیش درباره ارتباطش با نادر طالب‌زاده، نوشت: «اعتماد نادر به من نتیجه مستقیم مفید بودنم بود. او به قدرتِ قلم من و ارتباطاتم درون جهان عرب (و تا حدودی غرب) باور داشت. این موضوع وقتی برای من روشن شد که دیدم در پی اعتراض نیروهای سپاه به قرار گفت‌وگوی من با ابراهیم رئیسی، نادر شخصا پا پیش گذاشت و دخالت کرد.»
اعضای خانواده تورج نگهبان، شاعر و ترانه‌سرای فقید و خالق ترانه «ای ایران ایران»، نسبت به اجرای نوحه‌ای برگرفته از این ترانه توسط یک مداح حکومتی در حضور علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی، اعتراض کردند و این اقدام را «نهایت ریاکاری» خواندند.
دفتر علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی، ویدیویی منتشر کرد که در آن نشان می‌دهد محمود کریمی، مداح مورد علاقه خامنهای، نسخه دستکاری شده ترانه معروف «ای ایران» محمد نوری را که از شروع عزاداری‌های محرم امسال، خوانده بود، تکرار کرد. محمود کریمی گفت که این ترانه را به درخواست خامنهای می‌خواند.
علی خامنهای، رهبر جمهوری اسلامی، ۱۰ روز پس از آتش‌بس با اسرائیل، و در روز شنبه ۱۴ تیر ۱۴۰۴ بالاخره از مخفی‌گاه خود خارج شد و در مراسم عزاداری شب عاشورا در حسینیه خمینی تهران، حاضر شد. تصاویر منتشر شده توسط دفتر او، نشان می‌دهد حاضران، از حضور ناگهانی خامنهای، شوکه شده‌اند.
جمهوری اسلامی پس از درگیری ۱۲ روزه با اسرائیل، با ادعای پیروزی و سرکوب مردم، همچنان به حیات خود ادامه می‌دهد. اما مسیر آینده ایران به کجا خواهد انجامید؟
ولی‌رضا نصر، پژوهشگر سیاست خاورمیانه در مقاله‌ای تحلیلی با عنوان «رهبر ایران برنامه دارد» که در تاریخ ۲۶ ژوئن ۲۰۲۵ در نیویورک تایمز منتشر شد، به بررسی راهبرد آیت‌الله علی خامنهای در قبال حملات اخیر آمریکا و اسرائیل می‌پردازد.
رابین رایت در یادداشتی در مجله نیویورکر که همزمان با اتش‌بس جمهوری اسلامی و اسرائیل منتشر شده، آینده جمهوری اسلامی ایران پس از حملات نظامی آمریکا و اسرائیل را بررسی می‌کند. این مقاله تحلیل می‌کند که بقا یا سقوط نظام ایران، بیش از قدرت نظامی دشمنانش، به ساختار داخلی، فرهنگ شیعی و نارضایتی عمومی مردم بستگی دارد.