او این جنگ را موجب بروز اراده و قدرت جمهوری اسلامی و به رخ کشیدن استحکام بینظیر پایههای آن خواندند و با تأکید بر اینکه «علت اصلی دشمنیها، مخالفت بدخواهان با ایمان، دانش و اتحاد ملت ایران است»، گفت: ملت ما به توفیق الهی راه تقویت ایمان و گسترش دانشهای گوناگون را رها نخواهد کرد و به کوری دشمن خواهیم توانست ایران را به اوج ترقی و افتخار برسانیم.
خامنهای، واکنش ضد جنگ مردم ایران در دفاع از میهن را به نام قدرت جمهوری اسلامی خواند و گفت: «ملت ایران علاوه بر افتخارات بزرگی که در این ۱۲ روز کسب کرد و امروز همه دنیا به آن اعتراف میکنند، توانست قدرت، استقامت، عزم، و اراده و دستِپُر خود را به دنیا نشان دهد به طوری که همه قدرت جمهوری اسلامی را از نزدیک احساس کردند.»
به عقیده رهبر جمهوری اسلامی، این جنگ امتیازاتی داشته، از جمله باعث «استحکام بینظیر پایههای جمهوری اسلامی» شده است: «این حوادث برای ما بیسابقه نبود و جمهوری اسلامی در طول ۴۶ سال گذشته علاوه بر جنگ تحمیلی هشتساله، بارها در مقابل حوادثی همچون کودتا، فتنههای گوناگون نظامی، سیاسی و امنیتی و وادار کردن افراد سستعنصر به اقدام در مقابل ملت قرار گرفته و همه توطئههای دشمن را خنثی کرده بود.»
او مدعی شد بنای جمهوری اسلامی بر دو پایه «دین» و «دانش» است: «مردم و جوانان ایران با تکیه بر این دو پایه دشمن را در میدانهای مختلف به عقبنشینی وادار کردند و از این پس نیز همینگونه عمل خواهند کرد.»
خامنهای مدعی شد که آمریکا به دلیل «دین و دانش و اتحاد ایرانیان زیر سایه قرآن و اسلام» با جمهوری اسلامی، دشمنی دارد: «آنچه آنها به عنوان هستهای، غنیسازی و حقوق بشر مطرح میکنند بهانه است و علت اصلی ناراحتی و مخالفت آنها به میدان آمدن سخن نو و تواناییهای جمهوری اسلامی در عرصههای گوناگون علمی و دانشهای انسانی، فنی و دینی است. ملت ایران به توفیق الهی دین و دانش خود را رها نخواهد کرد، ما در راه تقویت دین و گسترش و تعمیق دانشهای گوناگون خود قدمهای بلندی برخواهیم داشت و به کوری دشمن خواهیم توانست ایران را به اوج ترقی و افتخار برسانیم.»