مجاهد کورکور روز ۲۹ آذر ۱۴۰۱، در جریان یورش نیروهای امنیتی به روستای «پِرسوراخ» در اطراف ایذه بازداشت شد.
شعبه اول دادگاه انقلاب اهواز، فروردین سال بعد، او را به اتهام «محاربه و افساد فی‌الارض» به اعدام محکوم کرد؛ حکمی که در دی‌ماه همان سال، توسط شعبه ۳۹ دیوان عالی کشور تایید و برای اجرا به دادگاه ایذه ارجاع شد.
بامداد دوشنبه ۲۱ خرداد ۱۴۰۴، رسانه‌های حکومتی در ایران اعلام کردند که حکم اعدام مجاهد کورکور در زندان به اجرا درآمده است.
ساعاتی پیش از اعلام این خبر، گزارش‌هایی در شبکه‌های اجتماعی درباره فراخوانده شدن خانواده او برای آخرین ملاقات منتشر شده بود، هرچند تا لحظه اعدام این گزارش‌ها از سوی خانواده کورکور رسماً تایید نشده بودند.